Ви є тут

ВИКОРИСТАННЯ RAPD-МАРКЕРІВ ДЛЯ ВИВЧЕННЯ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧНОГО ПОЛІМОРФІЗМУ У ВИДІВ РОДУ MISCANTHUS

Метою роботи є дослідження молекулярно-генетичного поліморфізму у представників різних видів, що представлені кількома популяціями рослин біоенергетичних культур роду Miscanthus колекції Інституту біоенергетичних культур і цукрових буряків НААН України. Пошук та підбір молекулярних маркерів для їх диференціації за умов використання RAPD PCR методик.
Методи. У дослідженнях застосовували молекулярно-генетичний метод детекції поліморфізму шляхом аналізу довжин фрагментів ампліфікації, отриманих у результаті RAPD PCR. Розрахунки проводили за допомогою комп’ютерних програм Excel, Statistica 6.0.
Результати. При проведенні ампліфікації 7-ма RAPD-праймерами отримано 28 локусів, 23 з яких виявилися поліморфними. Рівень поліморфізму в середньому склав 65 %. Індекс поліморфності локусу коливався в межах від 0,17 до 0,56. У досліджуваних зразках роду Miscanthus найбільшу кількість алелей ідентифіковано маркером Р822 – шість із розміром від 230 до 613 п.н. Праймер Р820 ампліфікував два локуси розміром 311 та 482 п.н., за маркерами Р816 і Р817 ідентифіковано по три алелі розміром від 219 до 530 п.н. Спектри ампліконів, отримані з використанням зазначених вище праймерів, дають змогу диференціювати представників роду Miscanthus різних видів, адже встановлено різницю за кількістю локусів для кожного представника виду. Унікальний алель з частотою 0,35, розмір якого 605 п.н., було отримано з використанням праймера RAPD2.
Висновки. За результатами проведених досліджень встановлено доцільність використання праймерів P816 та RAPD2 для диференціювання різних генотипів видів M. sacchariflorus, M. gigantheus, M. sinensis. Отримана велика частка поліморфних локусів і, як наслідок, високий рівень поліморфізму підтверджують популяційний склад модельної вибірки.
Ключові слова: види роду Miscanthus, RAPD PCR, поліморфізм, частоти алелей.

 

 

Посилання: 
1. Енергетичний баланс України за 2017 рік. Державна служба статистики України. URL: http://www.ukrstat.gov.ua/ express/expr2018/12/192.pdf.
2. MISCANTHUS/Міскантус. URL: http:c-13.herbs.on-planet.net/ MISCANTHUS_Miskantus.htm.
3. Мискантус. URL: http:www.kazedu.kz/referat/161223
4. Зінченко О.В. Біохімічні особливості рослин miscanthus giganteus в умовах Полісся України. Агропромислове виробництво Полісся. 2015. Вип. 8. С.127–129.
5. Мискантус. URL: http:www.tsvetnik.info/ lawn/ lawn _Miskantus.htm.
6. Альтернативні джерела енергії. URL: http:www.kazedu.kz/referat/161223
7. Cichorz S., Goska M., Litwiniec A. Miscanthus: Genetic Diversity and Genotype Identification Using ISSR and RAPD Markers. Mol. Biotechnol. 2014. Vol. 56. P. 911–924.
8. Сиволап Ю.М. Использование ПЦР-анализа в генетико-селекционных исследованиях: научно-методическое руководство. Київ: Аграрна наука, 1998. С. 8–70.
9. Визначення молекулярно-генетичного поліморфізму роду Beta L. за допомогою полімеразної ланцюгової реакції : методичні рекомендації / Роїк М.В. та ін. Київ: Поліграф Консалтинг, 2007. 27 с.
10. Саналатий А. В., Солоденко А. Е., Сиволап Ю. М. Идентификация генотипов подсолнечника украинской селекции при помощи SSRP-анализа. Цитология и генетика. 2006. №4. С. 37–43.
 
Завантажити статью: 
ДолученняРозмір
PDF icon babuyag-1-2019.pdf727.62 КБ